또한 원두는 다이어트뿐만 아니라 우리 몸에 더욱 큰 건강효능을 가져다준다. 우리 몸에서 항산화물질로 작용하는 폴리페놀의 일종인 클로로겐산이 풍부하게 함유되어 있다. 항산화는 말 그대로 산화를 억제하는 작용으로, 공기를 들이마셔 숨을 쉬고 음식을 섭취하며 살아가는 동안 활성산소에 의해 세포가 산화되는 작용을 막아주는 것을 뜻한다. 따라서 원두에 풍부하게 함유되어 있는 클로로겐산 성분이 체내 활성산소를 억제하고 세포 손상을 막아준다는 것이다. 특히 원두커피 한 잔의 항산화 효과는 비타민C를 300~590mg 섭취한 것과 동일한 효능이 있다고 한다. 국내 한 연구결과에 따르면 하루 2잔~5잔 사이의 커피는 면역력과 항산화 신호, 뼈 생성 촉진 등에 관여하는 단백질 발현에 좋은 반응을 보이며, 커피에 풍부하게 들어있는 성분들이 사람의 혈관 내피세포 기능에 유익한 영향을 준다고 밝혔다. 다만 과 섭취할 경우 오히려 카페인 독성이 높아져 효능이 떨어질 수 있으므로 하루 권장량을 지키는 것이 좋다.