이렇듯 복분자는 다양한 건강 이점을 가지고 있다. 그러나 모든 사람이 복분자를 섭취하면 좋은 것은 아니다. 특정 알레르기나 약물과의 상호 작용, 과다 섭취로 인한 부작용 등을 고려해야 한다. 그래서 개인의 건강 상태에 따라 적절한 양을 섭취하는 것이 중요하다.
첫째, 복분자 알레르기가 있는 경우 복분자를 섭취하지 말아야 한다. 복분자 알레르기는 피부 발진, 가려움증, 호흡 곤란 등의 증상을 유발할 수 있다.
둘째, 약물과 상호작용이 발생할 수 있다. 복분자는 혈액을 더 희석시키는 항응고제와 상호작용할 수 있다. 이러한 약물을 복용하는 사람은 의사와 상의 후 복분자를 섭취해야 한다.
셋째, 과다 섭취는 위장장애를 일으킬 수 있다. 복분자에는 다이어트 효과를 내는 섬유질이 풍부하다. 그러나 이 섬유질을 과다하게 섭취하면 소화 장애를 유발할 수 있다.